1: Замените експерименталне залихе на време

Подесите (НТЦ) негативну контролу и поновите то много пута.Када се утврди да постоји контаминација ПЦР производа у лабораторији, на време замените све експерименталне залихе.Као што су: поново разблажите и припремите прајмере, поново стерилишите врх пипете, ЕП епрувету, ддХ2О, итд., замените новом пипетом и привремено позајмите друге лабораторије за извођење ПЦР експеримената.Контаминирана лабораторија се проветрава и озрачи ултраљубичастим зрацима док се контаминација ПЦР производа не елиминише пре него што се настави са експериментом.

2: Продужите време излагања УВ зрачењу

Вреди напоменути да за уклањање контаминације ДНК редовно ултраљубичасто зрачење треба продужити за 2 сата него иначе.Чак и тако, ефекат УВ зрачења на уклањање малих фрагмената (испод 200 бп) контаминације ДНК и даље није добар.

Ултраљубичаста таласна дужина (нм) је углавном 254/300 нм и довољно је зрачити 30 минута.Треба напоменути да када се бира УВ за елиминисање контаминације резидуалних ПЦР производа, треба узети у обзир дужину ПЦР производа и дистрибуцију база у секвенци производа.УВ зрачење је ефикасно само за дугачке фрагменте изнад 500 бп, а има мали ефекат на кратке фрагменте.

Током УВ зрачења, пиримидинске базе у ПЦР производу ће формирати димере.Ови димери могу прекинути продужетак, али не могу сви пиримидини у ланцу ДНК да формирају димере, а УВ зрачење такође може разбити димере..Степен формирања димера зависи од УВ таласне дужине, типа пиримидинског димера и секвенце нуклеотида поред места димера.Стога, ако су фрагменти амплификовани ПЦР-ом мали, препоручује се коришћење система контаминације УНГ анти-ПЦР производа.

3: Често коришћени чистачи ДНК загађења

Аеросоли се лако стварају када се додају пипете, што је тешко избећи и брзо ће се таложити.Стога је несумњиво добар избор да се често користе специјалне чистаче загађивача ДНК како би се спречило ширење загађења ДНК.

4: Користите УНГ систем против загађења

Након што се уклони контаминација ПЦР производа, лабораторија за тестирање може да користи УНГ анти-ПЦР систем контаминације производа да спречи контаминацију ПЦР производа.У општим лабораторијама можете извршити једноставне експерименталне партиције, стриктно одвојити област ПЦР производа од других области, успоставити одређена лабораторијска правила и прописе и спровести одговарајућу обуку како бисте спречили појаву контаминације ПЦР производа.

Препоруке: Успостављање разумне ПЦР лабораторије, одржавање доброг окружења за ПЦР, формулисање стандардних ПЦР оперативних процедура и неговање ригорозне оперативне свести експериментатора су кључеви за спречавање или смањење загађења ПЦР експеримената.