Након што је амерички научник Ериц С. Ландер 1996. формално предложио полиморфизам једног нуклеотида (СНП) као молекуларни маркер треће генерације, СНП се широко користи у анализи асоцијација економских особина, изградњи мапе биолошке генетичке везе и скринингу хуманих патогених гена., Дијагноза и предвиђање ризика од болести, индивидуализовани скрининг лекова и друга биолошка и медицинска истраживања.У области оплемењивања новчаница, откривањем СНП-а може се остварити рана селекција потребних особина.Ова селекција има карактеристике високе тачности и може ефикасно да избегне мешање морфологије и фактора животне средине, чиме се у великој мери скраћује процес оплемењивања.Стога СНП игра огромну улогу у области основних истраживања.

Полиморфизам једног нуклеотида (Сингле Нуцлеотиде Полиморпхисм, СНП) се односи на феномен да постоје разлике у једном нуклеотиду на истој позицији у ДНК секвенци појединаца исте или различите врсте.Уметање, брисање, конверзија и инверзија једне базе могу изазвати ову разлику.У прошлости се дефиниција СНП-а разликовала од дефиниције мутације.Варијантни локус захтева да учесталост једног од алела у популацији буде већа од 1% да би се дефинисао као СНП локус.Међутим, са ширењем савремених биолошких теорија и применом технологије, фреквенција алела више није неопходан услов за ограничавање дефиниције СНП.Према подацима о варијацијама једног нуклеотида који су укључени у базу података полиморфизама једног нуклеотида (дбСНП) у оквиру Националног центра за биотехнолошке информације (НЦБИ), нискофреквентно уметање/делеција, варијације микросателита, итд.

У људском телу, учесталост СНП је 0,1%.Другим речима, у просеку постоји једна СНП локација на 1000 базних парова.Иако је учесталост појављивања релативно висока, не могу све локације СНП-а бити кандидати за маркере који се односе на особине.Ово се углавном односи на локацију на којој се СНП јавља.

Теоретски, СНП се може појавити било где у секвенци генома.СНП-ови који се јављају у кодирајућем региону могу произвести синонимне и несинонимне мутације, то јест, аминокиселине се мењају или не мењају пре и после мутације.Промењена аминокиселина обично узрокује да пептидни ланац изгуби своју првобитну функцију (мисенс мутација), а такође може да изазове прекид транслације (бесмислена мутација).СНП-ови који се јављају у некодирајућим регионима и међугенским регионима могу утицати на спајање мРНК, састав некодирајуће РНК секвенце и ефикасност везивања фактора транскрипције и ДНК.Конкретан однос је приказан на слици:

СНП типови:

Неколико уобичајених метода куцања СНП-а и њихово поређење

Према различитим принципима, уобичајене методе детекције СНП-а су подељене у следеће категорије:

Класификационо поређење метода детекције

Напомена: Наведене у табели тренутно се користе чешће методе детекције СНП, друге методе детекције као што су хибридизација специфичног места (АСХ), екстензија прајмера за специфично место (АСПЕ), проширење једне базе (СБЦЕ), сечење специфичног места (АСЦ), технологија генских чипова, технологија масене спектрометрије, итд. нису класификоване и упоређене.

Цена и време пречишћавања нуклеинске киселине у горе наведених неколико уобичајених метода детекције СНП су неизбежни.Међутим, сродни комплети засновани на Форегене-овој директној ПЦР технологији могу директно да изврше ПЦР или кПЦР амплификацију на непречишћеним узорцима, што доноси невиђену погодност за СНП детекцију.

Форегене производи из серије директних ПЦР једноставно и грубо изостављају кораке пречишћавања узорака, што у великој мери смањује време и трошкове потребне за припрему шаблона.Јединствена Так полимераза има одличну способност амплификације и може толерисати различите инхибиторе из сложених окружења за појачавање.Ове карактеристике пружају техничку гаранцију за добијање специфичних производа високог приноса. Форегене Дирецт ПЦР/кПЦР комплети за различите типове узорака, као што су: животињско ткиво (реп пацова, зебра, итд.), лишће биљака, семе (укључујући узорке полисахарида и полифенола) итд.