• Фејсбук
  • линкедин
  • ЈуТјуб

Низак однос А260/А230 обично је узрокован нечистоћама са максималном таласном дужином апсорпције на 230нм.Хајде да видимо шта ове нечистоће укључују:

  • Уобичајени загађивачи

    Таласна дужина апсорпције

    Ефекат односа

    Беланчевина

    ~230нм и 280нм

    Истовремено смањење А260/A 280и А260/A 280односима

    Гванидинска со

    220-240 нм

    Смањите А260/A 280однос

    фенол

    ~270нм

    -

    Тризол

    ~230нм и 270нм

    Смањите А260/A 280однос

    ЕДТА

    ~230нм

    Смањите А260/A 280однос

    Етанол

    230-240 нм

    Смањите А260/A 280однос

 
 
 
Таласна дужина апсорпције и вредност контраста уобичајених загађивача

Pконтаминација ротеином
Загађење протеинима се може сматрати најчешћим загађењем у процесу екстракције нуклеинске киселине.Протеин постоји између горње водене фазе и доњеорганскифаза .Загађење ће смањити однос А260/А280 и А260/А230 у исто време, а однос А260/А230 ће се променити очигледније од односа А260/А280.
Током накнаднихреверзна транскрипцијаor кПЦР реакције, протеински остаци могу инхибирати или ометати функцију ензима.Најбољи начин да се избегне контаминација протеинима је да се има на уму принцип „пре мање него више, мала количина много пута“ када се аспирира супернатант.

2. Загађење гванидинијумом
хидрохлорид (ГуХЦл) и гванидин тиоцијанат (ГТЦ) имају ефекат денатурације протеина, који могу брзо да униште ћелијске мембране током процеса екстракције нуклеинске киселине, изазивајући денатурацију протеина и таложење.Таласна дужина апсорпције ГуХЦл и ГТЦ је између 220-240 нм, азаостала со гванидинијума ће смањити однос А260/А230.Иако ће заостала со гванидинијума смањити однос,утицај на низводне експерименте је заправо занемарљив.

3. Тризол контаминација
Главна компонента Тризола је фенол.Главна функција фенола је да лизира ћелије и ослобађа протеине и супстанце нуклеинске киселине у ћелијама.Иако фенол може ефикасно денатурисати протеине, он не може у потпуности инхибирати активност РНазе.Због тога се ТРИзолу додају 8-хидроксихинолин, гванидин изотиоцијанат, β-меркаптоетанол, итд. да би се инхибирала ендогена и егзогена РНКаза.
Приликом екстракције ћелијске РНК, Тризол може брзо да лизира ћелије и инхибира ослобађање нуклеазе из ћелија, а резидуални Тризол ће значајно смањити однос А260/А230.
Метода обраде: Приликом центрифугирања треба имати на уму да је фенол у Тризолу лако растворљив у воденој фази под условима од 4° и собне температуре.

4. Остатак етанола
Етанол се користи у коначном процесу за таложење ДНК док се растварају јони соли који могу бити везани за ДНК.Таласна дужина апсорпције највишеапсорпциони врх одетанол је такође на 230-240 нм, штотакође ће смањити однос А260/А230.
Метода избегавања остатка етанола може се поновити два пута током завршног елуирања, дувањем укапелидва минута да би се омогућило да етанол потпуно испари пре додавања пуфера за елуирање.
Међутим, треба знати да је тај однос само индекс евалуације квалитета РНК.Ако су горе поменуте операције стриктно регулисане, одступање између односа и стандардног опсега неће имати велики утицај на низводне експерименте.
Сродни производи:
Комплет за изолацију укупне РНК животиња
Комплет за изолацију укупне РНК биљака
Комплет за изолацију укупне РНК ћелија
Комплет за изолацију укупне РНК биљака Плус


Време поста: Феб-10-2023